Máy tạo natri hypoclorit có thể được sử dụng để xử lý cấp nước thứ cấp

Khi  sodium hypochlorite  tiếp xúc với nước, nó bị thủy phân tạo thành các ion hypochlorite và hypochlorite. Trong số đó, hypochlorite có đặc tính oxy hóa mạnh và có thể phá hủy protein và các hệ enzyme khác của vi khuẩn (vi rút), từ đó tiêu diệt các vi sinh vật gây bệnh. Hiệu quả khử trùng liên tục bằng clo dư, thao tác đơn giản, an toàn và tiện lợi hơn clo lỏng và rẻ hơn bột tẩy.

So với khử trùng bằng khí clo, natri hypochlorite có rủi ro an toàn thấp hơn, không gây ra bất kỳ nguy cơ rò rỉ nào đối với an toàn tính mạng con người và không tạo ra các sản phẩm phụ độc hại hoặc có hại. Các nghiên cứu đã chỉ ra rằng trong quá trình khử trùng bằng natri hypoclorit, axit dichloroacetic (DCAA) trong nước nhà máy thấp hơn so với khử trùng bằng clo lỏng, trong khi axit trichloroacetic (TCAA) về cơ bản là tương đương. Khi natri hypochlorite được sử dụng để khử trùng, trihalomethanes (THM) trong nước nhà máy thấp hơn clo lỏng và carbon tetrachloride (CCl4) về cơ bản tương đương với cả hai. Nhìn chung, lượng sản phẩm phụ khử trùng bằng natri hypoclorit thấp hơn so với clo lỏng.